"국립나주문화재연구소전라남도‧제주지역에 산재한 문화유산의 체계적인 학술조사와 연구를 위하여 2005년 10월 18일 설립되었다."

국립나주문화재연구소는 전라남도‧제주지역에 산재한 문화유적의 학술조사 및 긴급발굴조사를 통해 문화유산의 가치를 발굴해 나아가고 이를 역사교육과 문화관광자원으로 활용할 수 있도록 기초자료를 제공하고 있다.

특히 대형옹관고분, 전방후원형분, 대규모 지석묘군 등 관련 유적을 조사·연구하여 전라남도‧제주지역 고대문화의 성격과 실체를 규명하는 데 중점을 두고 있다.

또한 전라남도‧제주지역에 산재한 문화유산 조사·연구자료를 분야와 시대에 따라 체계적으로 집대성하여 관련 학계 및 일반인에게 제공하고 있다.