2009. 04. 29
基本運営規定の改定により本所課名称変更。文化財保存科学センター、地方文化財研究所内に室・課 新設(国立文化財研究所訓令 第10号)
2008. 08. 12
遺跡調査研究室を考古研究室に、美術工芸研究室を美術文化財研究室に、伝統建築研究室を建築文化財研究室に、芸能民俗研究室を無形文化財研究室にそれぞれ室名称 変更(国立文化財研究所訓令 第7号)
2007. 11. 30
国立中原文化財研究所 新設、昌原文化財研究所を伽倻文化財研究所に名称変更(大統領令 第20420号、文化観光部令 第176号、国立文化財研究所訓令 第4号)
2007. 03. 15
研究企画課 新設(国立文化財研究所訓令 第2号)
2007. 01. 01
国立文化財研究所の責任運営機関に指定(大統領令 第19795号)
2006. 04. 06
自然文化財研究室 新設(文化観光部令 第135号)
2005. 08. 16
国立羅州文化財研究所 新設(大統領令 第19001号)
2004. 01 .17
大田大徳研究団地に新庁舎移転
2003. 07. 25
建造物研究室 新設(大統領令 第18061号)